Kolekcja Drobnoustrojów Instytutu Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN obejmuje ok. 2500 szczepów bakterii. Gromadzone szczepy to w dużej mierze szczepy typowe - otrzymane ze znanych światowych kolekcji (ATCC, NCTC, CIP, CCM, JCM, DSM, CNCC, CCUG, NRRL i inne). Szczepy są konserwowane (liofilizacja), przechowywane i dostarczane w miarę potrzeby pracownikom Instytutu oraz zainteresowanym laboratoriom krajowym i zagranicznym. Szczepy kolekcji służą jako referencyjny materiał badawczy. Kolekcja obejmuje zestawy szczepów do badania aktywności antybiotyków, środków dezynfekcyjnych, związków rakotwórczych, lizozymu i fagocytów. Dysponujemy m.in. szczepami znanymi z produkcji antybiotyków, enzymów, białka A, etanolu, substancji czynnych immunologicznie oraz szczepami znanymi z degradacji fenolu, toluenu i cyjanków. Zainteresowanym udziela się informacji nt. źródeł, cech i wymogów drobnoustrojów oraz udostępnia się nasz Katalog Drobnoustrojów.

Kolekcja Instytutu zarejestrowana jest w światowej Federacji Kolekcji Drobnoustrojów (WFCC) pod numerem 106 z akronimem PCM (Polish Collection of Microorganisms) oraz w Europejskiej Organizacji Kolekcji Drobnoustrojów (ECCO). Kierownikiem Kolekcji jest doc. dr Andrzej Gamian, kuratorem dr Stefan Rowiński.